Realmente a versão atual do Zend não tem o install.sh. O que vc deve fazer é colocar o ZendOptimizer.so em uma pasta (pode ser /usr/local/Zend/ZendOptimizer mesmo) e no PHP.INI colocar no final do arquivo o seguinte:
[Zend]
zend_optimizer.version=3.3.9
zend_extension=/usr/local/Zend/ZendOptimizer.so
Depois é só restartar o Apache.